肠胃炎治疗需根据病因和症状选择药物，多数病毒性肠胃炎无需抗生素，以补液和对症治疗为主，细菌性肠胃炎可考虑抗生素，同时需注意特殊人群用药安全。
- 病毒性肠胃炎：通常由诺如病毒、轮状病毒等引起，病程较短（1~3天），主要采用口服补液盐预防脱水，可适当使用蒙脱石散保护肠黏膜，婴幼儿需注意避免脱水，必要时就医。
- 细菌性肠胃炎：由沙门氏菌、大肠杆菌等感染，可能伴随发热和黏液便，需在医生指导下使用抗生素，如喹诺酮类、头孢类，孕妇及哺乳期女性需谨慎选择，避免影响胎儿或婴儿。
- 寄生虫性肠胃炎：如贾第虫感染，需使用甲硝唑等抗寄生虫药物，治疗期间需注意个人卫生，避免重复感染，儿童用药需严格按年龄调整剂量。
- 饮食不当或刺激性肠胃炎：可短期使用益生菌调节肠道菌群，避免油腻、辛辣食物，老年人和慢性病患者需注意饮食清淡，避免药物相互作用。
- 特殊人群注意事项：儿童尤其是婴幼儿应避免自行使用止泻药，可在医生指导下使用口服补液盐；孕妇禁用喹诺酮类抗生素，建议使用头孢类或阿奇霉素；肾功能不全者需调整用药剂量，避免药物蓄积。