始基子宫治疗以手术和激素干预为主，手术适用于有周期性腹痛者，激素治疗用于促进第二性征发育，辅助生殖技术仅适用于子宫发育接近正常者。
- 手术治疗：适用于有周期性腹痛或宫腔积血者，通过宫腔镜下子宫成形术或子宫切除术缓解症状，术后需长期随访预防并发症。
- 激素替代治疗：青春期女性可给予雌激素促进乳房发育，必要时联合孕激素建立人工周期，需定期监测激素水平调整方案。
- 辅助生殖技术：仅适用于子宫发育接近正常且卵巢功能正常者，通过胚胎移植尝试妊娠，但成功率受子宫发育程度限制。
- 特殊人群注意事项：低龄患者优先非药物干预，避免过早手术；有心血管疾病史者需谨慎使用激素，用药期间定期复查。