盐酸小檗碱片主要用于治疗敏感病原菌所致的胃肠道感染，如胃肠炎、细菌性痢疾等，对部分感染性腹泻也有辅助治疗作用。
- 胃肠道感染治疗：其通过抑制细菌蛋白合成发挥抗菌作用，对大肠杆菌、痢疾杆菌等常见致病菌效果明确，临床常用于缓解肠道细菌感染引起的腹痛、腹泻、黏液便等症状。
- 感染性腹泻辅助治疗：尤其适用于细菌感染性腹泻，如因饮食不洁或肠道菌群紊乱引发的腹泻，可帮助控制感染源，缩短病程，但需注意与其他抗病毒或对症药物配合使用。
- 特殊人群注意：孕妇、哺乳期妇女及儿童应在医生指导下谨慎使用，肝肾功能不全者需监测药物反应，避免长期或过量使用。
- 非感染性腹泻不适用：对病毒感染（如轮状病毒）、寄生虫感染或功能性腹泻（如肠易激综合征）无效，需先明确病因再对症处理。
用药期间若出现皮疹、恶心、呕吐等不适，应及时就医。