脑干堵塞后果严重，可致意识障碍、呼吸循环衰竭，甚至在数小时内危及生命，黄金救治期为发病4.5小时内。
- 高位脑干堵塞：累及中脑或脑桥上部，常引发严重意识障碍，如昏迷或植物状态，同时可能导致眼球运动障碍、面部麻木、吞咽困难，甚至呼吸节律异常，需依赖呼吸机维持生命。
- 低位脑干堵塞：影响脑桥下部或延髓，主要表现为呼吸、心跳节律紊乱，如呼吸暂停、心动过缓，严重时可因循环衰竭迅速致命。部分患者还会出现构音障碍、肢体瘫痪。
- 特殊人群风险：老年患者因血管硬化、合并高血压等基础疾病，堵塞后恢复更差；儿童患者罕见，但先天性血管畸形或感染可能诱发，需紧急神经介入或手术干预。
- 后遗症与康复：存活者常遗留肢体瘫痪、吞咽困难、言语障碍，需长期康复训练。早期高压氧治疗及神经保护药物（如胞磷胆碱）可能改善预后，但需在医生指导下进行。