石菖蒲具有开窍豁痰、醒神益智、化湿开胃的功效，现代研究表明其可能对认知功能、胃肠功能及神经系统调节有一定作用。
- 认知功能改善：临床研究发现石菖蒲中的α-细辛醚等成分可调节脑内神经递质，对阿尔茨海默病患者的认知评分有改善趋势（时间范围：6个月-1年），但需在医生指导下使用。
- 神经系统调节：对癫痫患者的脑电图监测显示，石菖蒲能降低异常放电频率，但需配合规范抗癫痫治疗，不建议单独用于发作控制。
- 胃肠功能促进：其挥发油成分可促进胃肠蠕动，对功能性消化不良患者的腹胀、嗳气症状有缓解作用（研究样本量：100例），但急性胃肠炎患者禁用。
- 特殊人群注意：孕妇及哺乳期女性应避免大剂量使用；儿童需严格遵医嘱，不建议自行使用；肝肾功能不全者应谨慎，定期监测指标。
- 临床应用规范：作为传统中药，使用时需辨证施治，建议在正规医疗机构由中医师指导，避免长期单独使用影响肝肾功能。