低浓度阿托品控制近视存在一定副作用，主要表现为瞳孔散大、调节能力下降及眼部过敏等，通常在停药后可逐渐恢复。
- 瞳孔散大与调节异常：低浓度阿托品会使瞳孔扩大，导致畏光、看近模糊，尤其在强光环境下更明显。儿童调节能力较强，可能出现暂时性视疲劳，需注意避免强光刺激。
- 眼部过敏反应：少数人可能出现眼痒、眼红等过敏症状，若症状轻微可继续观察，严重时需停药并就医。
- 全身吸收影响：低浓度阿托品全身吸收量极低，但婴幼儿肝肾功能尚未完善，需谨慎使用，避免长期大面积使用。
- 长期安全性数据不足：目前研究多集中在短期效果，长期使用的安全性仍需更多数据支持，建议严格遵医嘱使用。
特殊人群注意：12岁以下儿童使用需评估风险，优先选择角膜塑形镜等非药物干预手段；过敏体质者慎用，用药期间定期监测眼压和视力变化。