肛脓肿治疗以手术为主，尽早切开引流是关键，同时需配合抗感染等综合措施。
- 单纯性脓肿：首选切开引流术，在脓肿波动感最明显处切开，放置引流条，术后需定期换药，保持引流通畅。糖尿病患者需严格控制血糖，否则易导致感染扩散。
- 复杂性脓肿：若脓肿范围大或已形成肛瘘，需行根治性手术，如肛瘘切开术、挂线疗法等，术后需长期随访，防止复发。老年患者愈合能力弱，需加强营养支持。
- 高位脓肿：位置较深，需在超声或CT引导下精准定位后切开引流，必要时结合抗生素治疗。儿童患者需避免过度哭闹，减少局部刺激。
- 合并感染扩散：出现发热、寒战等全身症状时，需静脉使用广谱抗生素，同时完善血常规、CRP等检查，明确感染程度。孕妇患者需权衡药物对胎儿影响，优先选择安全抗生素。