不做基因检测时，部分靶向治疗可在特定肿瘤类型中尝试，但需严格评估风险与获益，多数情况下基因检测仍是优化靶向治疗的必要前提。
- 对于HER2阳性乳腺癌、EGFR突变阳性非小细胞肺癌等具有明确靶点的肿瘤，若未经基因检测直接使用对应靶向药（如曲妥珠单抗、吉非替尼），可能因靶点表达不足导致疗效不佳，甚至延误最佳治疗时机。
- 晚期胃癌、不明来源转移瘤等缺乏明确可靶向基因突变的肿瘤，临床靶向药物选择有限，更多依赖化疗或免疫治疗，此时不做基因检测对靶向治疗决策影响较小，但需结合患者体力状态调整方案。
- 急性淋巴细胞白血病伴中枢神经系统浸润等急重症患者，或因身体虚弱无法完成检测流程（如骨髓穿刺），医生可能在知情同意下尝试经验性靶向治疗，但需在治疗前充分告知潜在风险，治疗期间密切监测不良反应。
- 老年患者（≥75岁）或合并严重肝肾功能不全者，若检测等待时间过长（>2周），可在医生评估后优先选择传统治疗；儿童（<18岁）除非在严格的临床试验中，否则不建议使用靶向药，且需优先考虑非药物干预措施。