咳嗽有痰需检查血常规、胸部影像学检查（如胸片或CT）、痰液检查（包括痰培养及药敏试验），必要时进行肺功能检查，特殊人群需结合具体病史增加相关检查。
- 感染性咳嗽有痰：需检查血常规（评估白细胞及中性粒细胞比例判断感染类型）、C反应蛋白（CRP）及降钙素原（PCT），明确细菌或病毒感染；痰液检查明确病原体，指导抗生素使用。
- 慢性咳嗽有痰：需做胸部高分辨率CT（HRCT）排查支气管扩张、肺纤维化等结构性病变；肺功能检查评估气道阻塞或高反应性，排除哮喘、慢阻肺。
- 儿童及老年患者：儿童需增加过敏原检测（排查过敏性咳嗽）；老年患者建议加做血气分析，评估呼吸功能及缺氧情况，同时排查心功能不全导致的肺水肿。
- 特殊职业暴露者：长期接触粉尘、化学物质者，需进行胸部影像学检查及肺功能检测，排除尘肺、间质性肺病等职业病。
- 长期吸烟或有肺癌史者：需重点进行胸部增强CT及肿瘤标志物检测，排查肺癌风险，必要时行支气管镜检查。